هسته اصلی سپهر از سال ۱۳۸۵ و با ایده ایجاد یک سیستم کاملا ایرانی بر اساس تکنولوژی های نو تشکیل گردید. پس از آن این شرکت با نام رسمی رایانش ابری هوشمند سپاهان به شماره ثبت ۵۲۹۰۱ به ثبت رسید. در سال 1396 این شرکت به عنوان شرکت دانش بنیان برگزیده شد.